Pemodelan Tiga Dimensi (3D) Ikatan Hasil Docking Molekular Turunan Diketopiperazin (DKP) Dengan Bcl-2 Pada Sel Mcf-7

Luthfiyah, Yuniyati and , Broto Santoso M.Sc., Apt (2014) Pemodelan Tiga Dimensi (3D) Ikatan Hasil Docking Molekular Turunan Diketopiperazin (DKP) Dengan Bcl-2 Pada Sel Mcf-7. Skripsi thesis, Universitas Muhammadiyah Surakarta.

[img]
Preview
PDF (Naskah publikasi)
2._naskah_publikasi.pdf

Download (665kB)
[img]
Preview
PDF (Halaman depan)
3._halaman_depan.pdf

Download (620kB)
[img]
Preview
PDF (Bab I)
4._BAB_I.pdf

Download (262kB)
[img] PDF (Bab II)
5._BAB_II.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (108kB)
[img] PDF (Bab III)
6._BAB_III.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (476kB)
[img] PDF (Bab IV)
7._BAB_IV.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (85kB)
[img]
Preview
PDF (Daftar pustaka)
8._DAFTAR_PUSTAKA.pdf

Download (164kB)
[img] PDF (Lampiran)
9._LAMPIRAN.pdf
Restricted to Repository staff only

Download (153kB)

Abstract

Kanker payudara merupakan tumor ganas yang dimulai dari sekelompok sel-sel kanker yang dapat tumbuh menyerang jaringan sekitarnya atau menyebar (metastasis) ke jaringan lain pada tubuh sebagai akibat dari ketidaknormalan proses apoptosis. Apoptosis dikendalikan oleh keluarga protein Bcl-2 yang terdiri dari pro-apoptosis seperti Bax dan Bak dan anti-apoptosis seperti Bcl-2 dan Bcl-XL. Sel kanker payudara MCF-7 tidak mengekspresikan caspase-3 sehingga upaya untuk menekan ekspresi Bcl-2 perlu dilakukan agar sel MCF-7 tidak terus-menerus membelah. Pencarian senyawa baru pada proses ini menggunakan metode molecular docking dengan software PyRx AutoDock-Vina. Proses preparasi ligan dan protein terlebih dahulu dilakukan, kemudian validasi metode penelitian yang digunakan menggunakan ligan DRO dengan hasil RMSD 0,054 dan nilai -6,2 Kkal/mol, preparasi ligan uji dan ligan pembanding, selanjutnya docking terhadap ligan-ligan tersebut. Proses ini menunjukkan interaksi antara ligan dan protein yang diamati untuk kemudian digunakan sebagai dasar penyusunan senyawa baru. Senyawa baru tersebut di-docking dan diamati kembali interaksi antara ligan dan protein. Nilai ikatan energi ligan baru nDRO -7,1 Kkal/mol, n715 -6,7 Kkal/mol; n099 -6,7 kkal/mol; n236 -6,4 Kkal/mol; n421 -6,1 Kkal/mol dan nDKP2 -6,4 Kkal/mol. Hasil tersebut menunjukkan turunan ligan DRO dan keempat senyawa lainnya memiliki nilai energi ikatan lebih baik dari ligan DRO, sehingga menunjukkan potensi inhibisi aktivitas berlebih Bcl-2 secara molecular docking.

Item Type: Karya ilmiah (Skripsi)
Uncontrolled Keywords: docking molekular, Bcl-2, MCF-7, kanker payudara
Subjects: R Medicine > RC Internal medicine > RC0254 Neoplasms. Tumors. Oncology (including Cancer)
Divisions: Fakultas Farmasi > Farmasi
Depositing User: Edy Susilo
Date Deposited: 03 Dec 2014 11:54
Last Modified: 16 Oct 2021 05:59
URI: http://eprints.ums.ac.id/id/eprint/31141

Actions (login required)

View Item View Item